I Danmark findes det thoraxkirurgiske speciale på fire centre som varetager thoraxkirurgiske patienter fra optageområdet. De fire centre er beliggende på de fire offentlige universitetshospitaler: Rigshospitalet, Aarhus Universitetshospital, Odense Universitetshospital og Aalborg Universitetshospital. Nogle centre har landsfunktion indenfor en lille del af specialet, mens alle offentlige thoraxkirurgiske afdelinger har landsdelsfunktioner og er højt specialiserede enheder (HSE).